蓝魔R9尊享版搭载的系统升级到了基于Android 5.1深度定制的MOUI V2.1版本，除了系统内置的基础软件之外，几乎没有预装任何第三方应用，并且主打应用分身功能，可以同时开启两个微信和两个QQ，省去了来回切换的烦恼，也让工作、生活得以完美区分。

    总体来说，MOUI V2.1没有什么十分突出的特点，但胜在使用流畅且在细节方面用心，极少的预装应用、支持微信/QQ分身都证明该系统为用户体验下了功夫，是用户在使用时更为顺畅并免去了许多需要切换应用带来的烦恼。